Tři roky po fúzi (2000) se společnost Semper Foods rozděluje a zůstává samostatnou dceřinou společností společnosti Arla.

V několika rušných letech získala společnost Hero v roce 2001 populární prémiovou portugalskou značku Casa de Mateus a v roce 2002 vstoupila na turecký trh jako společný podnik se společností Ülker se značkou Hero Baby. V témže roce společnost Hero získala většinový podíl ve společnosti Schwartau a vstoupila na švýcarský trh s dětskou výživou, když získala značky Adapta a Galactina společnosti Wander. Společnost také expandovala do východní Evropy koupí ochranné známky Sunar v České republice a na Slovensku.

Po 90. letech přechází společnost Hero do soukromého vlastnictví a v roce 2003 opouští burzu. Podnik Semper nutrition je prodán společnosti Novartis. Společnost Triton kupuje Semper a podnik se zaměřuje na kojeneckou výživu a bezlepkovou dietu. V květnu 2004 zakládá společnost Hero v České republice a na Slovensku pobočku s týmem 30 lidí.

V roce 2005 společnost Hero koupila společnosti Beech-Nut a Vitrac a vytvořila tak Hero Middle East & Africa. V roce 2006 se ke skupině připojila společnost Semper, jejíž součástí byla i společnost Juvela.

Budování znalostí v segmentu kojenecké výživy vedlo v roce 2006 k vytvoření Institutu dětské výživy v areálu v Alcantarille a centra pro inovace a kvalitu v německém Schwartau.

V roce 2007 získává společnost Hero značku Friso (dnes Hero Baby) od společnosti Friesland Foods a prostřednictvím licenční smlouvy se společností Blédina expanduje na ruský a belgický trh. Semper otevírá dvě dceřiné společnosti v Norsku a Finsku a o dva roky později další v Dánsku. Globální řada dětské výživy Hero Baby je společností Hero MEA uvedena na egyptský trh a rychle si získává velký podíl na egyptském a regionálním trhu.

V roce 2008 vstoupila společnost Hero do odvětví ekologické dětské výživy ve Spojeném království, a to prostřednictvím akvizice společnosti Organix. V tomto roce vznikla organizace Hero Russia, která převzala distribuční aktivity zahájené koncem 90. let. V roce 2009 byl v turecké Ankaře otevřen nový závod na výrobu dětské výživy v rámci společného podniku společností Hero a Ülker.

V roce 2010 získává společnost Semper v Korsnäs továrnu na výrobu křupavého chleba a mění ji na bezlepkovou pekárnu. Ve stejném roce prodává společnost Schwartau své oddělení pečení a zdobení skupině Dr. August Oetker v Bielefeldu, aby se mohla soustředit na své hlavní oblasti podnikání.

Budova nového sídla a továrny skupiny Hero Group v Lenzburg byla dokončena v roce 2011, přesně na 125. výročí založení společnosti. Dříve měla společnost své výrobní prostory a kanceláře hned vedle vlakového nádraží v Lenzburgu.

V roce 2012 se společnost Kiviks Marknad (Hero Brazil) přestěhovala do nového sídla v Itatibě a společnost Schwartau dokončila novou továrnu na výrobu džemů. V roce 2012, kdy společnost Hero Spain slavila 90leté výročí, byl do funkce generálního ředitele skupiny Hero Group jmenován nizozemský občan Rob Versloot. Tuto pozici zastává dodnes.

V roce 2015 bylo ukončeno společné podnikání společností Ülker a Hero, přičemž společnost Hero získala 100 % akcií a upevnila svou pozici v zemi. V prosinci skupina Hero Group vstoupila do společného podniku se společností Kiviks Marknad a název společnosti se změnil na Hero Brazil.

Po desetileté odmlce obnovila společnost Hero Portugal v roce 2015 značku Hero Baby, a to ve stejné době, kdy společnost Hero Spain oslavila 30. výročí od uvedení stejné značky na trh.

Leopold Oetker, syn čestného předsedy představenstva a hlavního akcionáře společnosti Hero Dr. Arenda Oetkera, byl jmenován do představenstva společnosti Hero, čímž se v roce 2016 ještě více posílil rodinný závazek vůči společnosti.

V roce 2018 se uskutečnila rozsáhlá investice (známá jako projekt Triple One) do závodu na výrobu kojenecké výživy ve švédském Götene. Mezitím společnost Hero a německá společnost erdbär GmbH, která se zabývá výrobou organické kojenecké a dětské výživy, uzavírají strategické partnerství, které skupině Hero Group umožní vstoupit na důležitý německý trh s výrobky kojenecké a dětské výživy, což je jedna z jejích hlavních kategorií.

Dr. Hasso Kaempfe odstupuje v roce 2019 z funkce předsedy představenstva společnosti Hero Group. Jeho nástupcem se stane Giovanni Ciserani, bývalý manažer společnosti P&G. Do představenstva je rovněž jmenována Margaret Verstedenová, výkonný ředitel bol.com. Tento rok je také rokem výročí, kdy společnost Semper slaví 80 let od svého založení a společnost Schwartau si připomíná 120 let od svého založení.

V roce 2020 uzavřela společnost Hero partnerství s italskou skupinou Angellini Group a vytvořila společnost MadreNatura, která vstupuje na italský trh s dětskou a kojeneckou výživou. Po složitém a zdlouhavém procesu získává skupina Hero Group ve svém španělském závodě certifikaci na výrobu ekologických výrobků pro čínský trh.

Začátkem roku 2021 získala skupina Hero Group většinový podíl v kanadské společnosti Baby Gourmet, která se zabývá výrobou ekologické výživy pro kojence a batolata. O rok později byla prodána britská bezlepková společnost Juvela, která je součástí skupiny.